Od kapetana se najviše očekuje

Karijeru je započeo u rodnom Baselu, a nakon što je promijenio nekoliko švicarskih prvoligaša, "eksplodirao" je u francuskom Rennesu, gdje je u 100 nastupa postigao čak 48 pogodaka. U sezoni 2004./2005. je s 20 golova bio najbolji strijelac francuske lige, a proglašen je i za švicarskog nogometaša godine. Sjajan učinak omogućio mu je transfer u redove Borussije iz Dortmunda za otprilike pet milijuna eura.

U prvoj sezoni je sa 16 golova bio najbolji strijelac Borussije, no u narednom periodu muku je mučio s ozljedama pa je propustio dobar dio Borussijinih nastupa. Kada je igrao zabijao je pogotke, pa je dortmundski dio karijere okončao s 31 pogotkom u 69 nastupa. Prošloga se ljeta odlučio vratiti u Basel gdje je opet bio uobičajeno učinkovit, sve do nove ozljede.

Za reprezentaciju debitirao je 2001. godine i bio jedna od ključnih karika najuspješnijeg niza švicarske reprezentacije u povijesti - plasmana na četiri uzastopna velika natjecanja (dva Europska i dva Svjetska prvenstva). Najbolji je strijelac u povijesti švicarske reprezentacije s 40 postignutih pogodaka, a s obzirom da ima tek 31 godinu, zacijelo će tu brojku i podebljati.

Na Europskom prvenstvu 2008. sudjelovao je samo na prvoj utakmici, nakon čega ga je ozljeda prikovala za klupu do kraja turnira. Usprkos teškoj ozljedi, Frei je ostao uz momčad do kraja natjecanja pa se tek onda podvrgnuo operativnom zahvatu. I ovog puta Frei ima problema s ozljedom, u veljači je slomio ruku, ali i on i švicarska nogometna javnost nada se da će biti spreman za izazove koje Švicarce čekaju na jugu Afrike.