Statistika
1. pretkolo
| 28.08.2012. 16:00 | Vrsar | 5:0 | Tomislav Pan | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Koprivnica | 5:4 | Vuteks Sloga | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Virovitica | 1:4 | Split | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Krka | 0:3 | Nedelišće | - |
| 29.08.2012. 16:00 | Libertas | 2:1 | Mladost Ždralovi | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Slunj | 2:1 | Zadrugar | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Tekstilac | 5:6 | Višnjevac | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Ivančica | 6:5 | Oriolik | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Mladost Repušnica | 1:2 | Zrinski | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Gorica | 4:0 | Sloboda Slakovec | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Bjelovar | 1:2 | Vinodol | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Novalja | 3:1 | Zagorec | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | Zelina | 9:0 | Mladost M. Otok | Izvještaj |
| 29.08.2012. 16:00 | GOŠK Dubrovnik | 3:0 | Jedinstvo Omladinac | - |
| 29.08.2012. 17:00 | Lokomotiva | 7:0 | Slavija Pleternica | Izvještaj |
| 29.08.2012. 18:00 | Zadar | 5:1 | Belišće | Izvještaj |
1/16 finala
| 25.09.2012. 15:30 | Gorica | 3:0 | Inter-Zaprešić | Izvještaj |
| 25.09.2012. 15:30 | Vrsar | 0:3 | Dinamo | Izvještaj |
| 25.09.2012. 17:00 | Lokomotiva | 4:2 | Segesta | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Slunj | 0:4 | Hajduk | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Libertas | 3:0 | Varaždin | - |
| 26.09.2012. 15:30 | Zrinski | 0:4 | Zagreb | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Vinodol | 0:2 | Cibalia | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Novalja | 0:1 | Osijek | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Ivančica | 1:2 | Slaven Belupo | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | GOŠK Dubrovnik | 4:3 ** | Šibenik | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Nedelišće | 1:0 * | Rijeka | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Koprivnica | 2:1 * | Pomorac | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Višnjevac | 1:2 | Istra 1961 | Izvještaj |
| 26.09.2012. 15:30 | Zelina | 3:0 | Karlovac 1919 | - |
| 26.09.2012. 16:30 | Zadar | 2:0 | Konavljanin | Izvještaj |
| 26.09.2012. 18:00 | Split | 5:1 | Zagora | Izvještaj |
Osmina finala
| 30.10.2012. 15:00 | Dinamo | 2:3 * | Zadar | Izvještaj |
| 30.10.2012. 15:00 | Zagreb | 1:2 | Zelina | Izvještaj |
| 30.10.2012. 17:00 | Lokomotiva | 3:2 | Libertas | Izvještaj |
| 30.10.2012. 17:00 | Slaven Belupo | 2:0 * | Koprivnica | Izvještaj |
| 30.10.2012. 17:00 | Osijek | 3:2 * | Istra 1961 | Izvještaj |
| 31.10.2012. 14:30 | GOŠK Dubrovnik | 2:0 * | Nedelišće | Izvještaj |
| 31.10.2012. 17:00 | Hajduk | 2:1 | Split | Izvještaj |
| 31.10.2012. 17:00 | Cibalia | 1:0 | Gorica | Izvještaj |
Četvrtfinale
| 20.11.2012. 13:30 | GOŠK Dubrovnik | 0:1 | Lokomotiva | Izvještaj |
| 20.11.2012. 17:00 | Zadar | 1:0 | Slaven Belupo | Izvještaj |
| 21.11.2012. 17:00 | Cibalia | 1:1 | Osijek | Izvještaj |
| 27.11.2012. 13:30 | Zelina | 1:1 | Hajduk | Izvještaj |
| 27.11.2012. 14:00 | Lokomotiva | 0:0 | GOŠK Dubrovnik | Izvještaj |
| 27.11.2012. 17:00 | Osijek | 1:3 | Cibalia | Izvještaj |
| 28.11.2012. 17:00 | Slaven Belupo | 3:1 | Zadar | Izvještaj |
| 12.12.2012. 17:00 | Hajduk | 2:0 | Zelina | Izvještaj |
Polufinale
| 03.04.2013. 19:00 | Cibalia | 1:1 | Lokomotiva | Izvještaj |
| 10.04.2013. 19:00 | Slaven Belupo | 1:2 | Hajduk | Izvještaj |
| 17.04.2013. 19:00 | Lokomotiva | 3:0 | Cibalia | Izvještaj |
| 17.04.2013. 19:00 | Hajduk | 1:1 | Slaven Belupo | Izvještaj |
Finale
| 08.05.2013. 19:30 | Hajduk | 2:1 | Lokomotiva | Izvještaj |
| 22.05.2013. 20:15 | Lokomotiva | 3:3 | Hajduk | Izvještaj |